Le Syndicat mixte de Besançon et de sa région pour le traitement des déchets (SYBERT) a été créé en 1999 pour se charger du traitement des déchets de trois communautés de communes/agglomération. Ces collectivités ont gardé la compétence « collecte des déchets » et ont transféré la partie « traitement » au SYBERT.
Le SYBERT gère le transfert, le tri et le traitement des déchets. Pour y parvenir il peut compter sur :
Au-delà de sa compétence « traitement », le SYBERT mène une politique globale de réduction des déchets. Pour cela il anime le plan local de prévention des déchets et développe le compostage de proximité (individuel et collectif).
Le SYBERT couvre un territoire de 165 communes qui regroupe 224 186 habitants (environ la moitié de la population du département du Doubs).