Le SYBERT couvre un territoire vaste d’environ 1250 km², soit 163 communes, et regroupe 228 333 habitants.
Il est composé d’une zone urbaine très dense, la ville de Besançon, et de vastes zones rurales boisées, au relief vallonné et parcouru de rivières : Doubs, Loue, Lison et Ognon.
Avec la réforme pour les collectivités territoriales induite par la loi NOTRe, notre territoire a évolué au 1er janvier 2017 et comporte à présent deux communautés de communes et une communauté d’agglomération :